120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5260 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 
558 aa  1120    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  48.11 
 
 
558 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  37.95 
 
 
559 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.23 
 
 
1107 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  25.35 
 
 
1041 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  27.22 
 
 
1263 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  26.03 
 
 
482 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  24.9 
 
 
757 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  26.05 
 
 
528 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  27.97 
 
 
416 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.76 
 
 
354 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  26.24 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.16 
 
 
892 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.04 
 
 
863 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  22.3 
 
 
713 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  24.94 
 
 
1024 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.15 
 
 
867 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  23.09 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.05 
 
 
1344 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.21 
 
 
886 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.3 
 
 
802 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  23.12 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  22.81 
 
 
1749 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  35.04 
 
 
447 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.83 
 
 
937 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  35.87 
 
 
647 aa  62  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.41 
 
 
467 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.83 
 
 
937 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  24.88 
 
 
1088 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
447 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
453 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.54 
 
 
1744 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.65 
 
 
307 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
447 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.85 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  32.73 
 
 
446 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  27.95 
 
 
1015 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  35.35 
 
 
396 aa  55.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  36 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
421 aa  54.7  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.83 
 
 
414 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
451 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
432 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
436 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.42 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  27.74 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  24.84 
 
 
447 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.03 
 
 
766 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.84 
 
 
296 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  31.82 
 
 
451 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.12 
 
 
531 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.81 
 
 
648 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.71 
 
 
204 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.91 
 
 
451 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
445 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
444 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.03 
 
 
980 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
437 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
440 aa  50.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  26.55 
 
 
543 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
444 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  29.73 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  25.2 
 
 
925 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.81 
 
 
448 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  37.14 
 
 
108 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
744 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  23.74 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.31 
 
 
565 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  25 
 
 
640 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.86 
 
 
242 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  33.8 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  31.87 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  31.25 
 
 
499 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.91 
 
 
451 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  26.61 
 
 
569 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  22.67 
 
 
2491 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  31.25 
 
 
2324 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
459 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
437 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
471 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.04 
 
 
760 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
441 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  35.9 
 
 
543 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.29 
 
 
1611 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
439 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
439 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  19.85 
 
 
476 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.39 
 
 
2132 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
437 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.7 
 
 
1085 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.07 
 
 
440 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  28.78 
 
 
899 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.48 
 
 
653 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  23.92 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.544485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>