59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2365 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 569 aa  1173    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.87 
 
 		 863 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.09 
 
 		 1263 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.3 
 
 		 1107 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.37 
 
 		 1041 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.19 
 
 		 757 aa  67  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.33 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.88 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.61 
 
 		 892 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.13 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.6 
 
 		 937 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.61 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.82 
 
 		 1015 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.58 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.8 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.85 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.16 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25 
 
 		 1744 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  23.08 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.91 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  34.29 
 
 		 291 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.87 
 
 		 648 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.03 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.14 
 
 		 1344 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  24.42 
 
 		 448 aa  50.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  32.29 
 
 		 647 aa  50.8  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  35.8 
 
 		 1749 aa  50.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  26.32 
 
 		 761 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.36 
 
 		 2132 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  26.61 
 
 		 558 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  26.67 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  22.64 
 
 		 293 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  27.47 
 
 		 293 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.57 
 
 		 980 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.03 
 
 		 472 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  24.63 
 
 		 242 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.05 
 
 		 802 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  30.83 
 
 		 656 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  29 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  25.89 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 1281 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  35.71 
 
 		 580 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.04 
 
 		 569 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  23.08 
 
 		 675 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  34.09 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  25.51 
 
 		 559 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  28.8 
 
 		 443 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.63 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.79 
 
 		 925 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  25.21 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.32 
 
 		 993 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  24.76 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  24.26 
 
 		 204 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.9 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>