128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5707 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 802 aa  1646    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  43.66 
 
 		 1088 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  41.34 
 
 		 569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  29.18 
 
 		 580 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.64 
 
 		 1041 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.72 
 
 		 713 aa  103  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.79 
 
 		 757 aa  100  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.11 
 
 		 1263 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.43 
 
 		 508 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.88 
 
 		 482 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.3 
 
 		 1107 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  27.55 
 
 		 528 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.09 
 
 		 354 aa  90.9  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 867 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.95 
 
 		 863 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.51 
 
 		 1015 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  33.73 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.36 
 
 		 416 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.39 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.71 
 
 		 761 aa  78.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.1 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.48 
 
 		 1749 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.94 
 
 		 1344 aa  73.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.53 
 
 		 307 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.84 
 
 		 937 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.84 
 
 		 937 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.95 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  29.82 
 
 		 656 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  25.91 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  36 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.06 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6139  hypothetical protein  36.84 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.83 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28.81 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  29.3 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  26.59 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  30.46 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.37 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.36 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.88 
 
 		 467 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  63.9  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  35.51 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.17 
 
 		 1024 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 436 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.78 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5172  hypothetical protein  42.86 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.47 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  35.29 
 
 		 980 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.73 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  29.82 
 
 		 149 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0685  hypothetical protein  30.3 
 
 		 443 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 		 439 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  27.68 
 
 		 434 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  30.41 
 
 		 601 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  29.06 
 
 		 414 aa  54.3  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.06 
 
 		 247 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4404  hypothetical protein  30.08 
 
 		 428 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1744 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 459 aa  52.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  29.95 
 
 		 249 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 445 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 437 aa  50.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 437 aa  50.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  28.25 
 
 		 509 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  29.38 
 
 		 230 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 445 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  33.79 
 
 		 447 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  26.61 
 
 		 2324 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 432 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  25.79 
 
 		 436 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  29.05 
 
 		 286 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  33.98 
 
 		 291 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  25.14 
 
 		 293 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  26.38 
 
 		 451 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  26.81 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 460 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  26.83 
 
 		 438 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 441 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 		 468 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  31.53 
 
 		 225 aa  49.3  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  25.43 
 
 		 413 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.3 
 
 		 305 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 437 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.54 
 
 		 447 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 440 aa  48.5  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  29.75 
 
 		 490 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  26.09 
 
 		 446 aa  48.9  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  34.17 
 
 		 443 aa  48.9  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 437 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.18 
 
 		 2132 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 441 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 447 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  26.95 
 
 		 484 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 451 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>