125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6144 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 528 aa  1083    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.55 
 
 		 802 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.71 
 
 		 1088 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.34 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.17 
 
 		 1107 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.84 
 
 		 863 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.42 
 
 		 1263 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34 
 
 		 1041 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.92 
 
 		 867 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.69 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.55 
 
 		 937 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.03 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.9 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.38 
 
 		 892 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  21.81 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4404  hypothetical protein  29.58 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.83 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.5 
 
 		 204 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  23.21 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.21 
 
 		 1015 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 444 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.88 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0685  hypothetical protein  32.58 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698438 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.1 
 
 		 1344 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.66 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  27.35 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  22.55 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.1 
 
 		 1749 aa  61.6  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  24.76 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1368  hypothetical protein  29.25 
 
 		 221 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000107124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25 
 
 		 1024 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.88 
 
 		 886 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.7 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.05 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.02 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1744 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.62 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.03 
 
 		 761 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  26.4 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  27.13 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.1 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  28.85 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  32.95 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.81 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  25.75 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  23.16 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  29.19 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  28.39 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 469 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.51 
 
 		 653 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  26.58 
 
 		 656 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2934  hypothetical protein  31.3 
 
 		 613 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  30.52 
 
 		 293 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 475 aa  53.5  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28 
 
 		 925 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  27.45 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  25.34 
 
 		 149 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.08 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  25.66 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  29.49 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.19 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 421 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 		 2324 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  51.2  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  29.92 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  30.83 
 
 		 558 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  26.14 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  27.38 
 
 		 448 aa  50.8  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 445 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  29.2 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  27.75 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  33.91 
 
 		 2580 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  29.55 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  32.14 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  23.74 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  28.14 
 
 		 583 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>