199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2737 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  81.55 
 
 		 499 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  100 
 
 		 440 aa  864    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  61.4 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  59.13 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  61.24 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  59.91 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  59.4 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  60.46 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  60.14 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  59.5 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  57.31 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  58.6 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  58.68 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  58.6 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  58.14 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  58.37 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  59.18 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  56.46 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  59.9 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  49.21 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  48.45 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  48.67 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  55.01 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  55.01 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  47.79 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  47.57 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  55.12 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  55.45 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  47.12 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  57.72 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  54.63 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  47.97 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  46.53 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  44.15 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  45.62 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 		 412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  45.86 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  43.88 
 
 		 490 aa  358  9e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  44.67 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  45.84 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  43.32 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  45.71 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  43.32 
 
 		 396 aa  343  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  40.53 
 
 		 484 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.02 
 
 		 432 aa  229  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.66 
 
 		 1263 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.64 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.84 
 
 		 937 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.8 
 
 		 307 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.52 
 
 		 892 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.83 
 
 		 242 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.52 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.54 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.22 
 
 		 1107 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.7 
 
 		 757 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.39 
 
 		 1041 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  37.2 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.42 
 
 		 863 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.95 
 
 		 1015 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.12 
 
 		 761 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.83 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.02 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  32.38 
 
 		 559 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  30.64 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.94 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.67 
 
 		 886 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.53 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.19 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.6 
 
 		 937 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  27.06 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.56 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.49 
 
 		 1024 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  30.32 
 
 		 755 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.57 
 
 		 1344 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.29 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  30.23 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  34.44 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  28.12 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.96 
 
 		 1749 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.56 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  26.4 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.9 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.89 
 
 		 615 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  31.77 
 
 		 788 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  34.21 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  29 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  29 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.8 
 
 		 788 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.8 
 
 		 788 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  28.99 
 
 		 731 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45682  predicted protein  26.22 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.382803  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25 
 
 		 565 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  35.48 
 
 		 675 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.38 
 
 		 972 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  31.52 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>