104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1016 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  81.21 
 
 
443 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  100 
 
 
547 aa  1117    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  71.79 
 
 
583 aa  810    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  74.78 
 
 
568 aa  828    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  62.86 
 
 
603 aa  683    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  70.76 
 
 
575 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  71.96 
 
 
565 aa  796    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  67.6 
 
 
574 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  75 
 
 
545 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  38.06 
 
 
615 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  36.15 
 
 
755 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  36.15 
 
 
731 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  36.26 
 
 
755 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  41.37 
 
 
755 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  40.53 
 
 
776 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.82 
 
 
788 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.82 
 
 
788 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.82 
 
 
788 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  35.53 
 
 
622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  34.48 
 
 
765 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  32.18 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  39.71 
 
 
388 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  31.36 
 
 
301 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.51 
 
 
375 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  29.18 
 
 
318 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  40.44 
 
 
581 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  33.33 
 
 
284 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  25.23 
 
 
1611 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  36.02 
 
 
763 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  36.88 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.87 
 
 
1494 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  31.6 
 
 
1495 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.48 
 
 
1498 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  27.96 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.86 
 
 
1497 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.82 
 
 
1496 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  24.94 
 
 
1459 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.75 
 
 
1439 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  24.73 
 
 
1473 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.44 
 
 
1439 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  24.83 
 
 
1473 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.53 
 
 
1498 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  26.16 
 
 
379 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.1 
 
 
1041 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  24.53 
 
 
1376 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  24.5 
 
 
1640 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  25.77 
 
 
1634 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  24.79 
 
 
1631 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.5 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.23 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.97 
 
 
863 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.46 
 
 
1744 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
447 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  28.44 
 
 
379 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  23.84 
 
 
1984 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.95 
 
 
1481 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  30.73 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.28 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.86 
 
 
565 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.18 
 
 
1395 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  24.89 
 
 
1990 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.73 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.65 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  35.07 
 
 
499 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.63 
 
 
1015 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  24.47 
 
 
1481 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  27.89 
 
 
1393 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
451 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.51 
 
 
416 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  31.52 
 
 
447 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  22.41 
 
 
1680 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.18 
 
 
1395 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.95 
 
 
1263 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.94 
 
 
867 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
453 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  33.93 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.21 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.3 
 
 
354 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
450 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
440 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.25 
 
 
242 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
475 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.57 
 
 
446 aa  47  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  34.04 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  27.75 
 
 
761 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.36 
 
 
1508 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.4 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.42 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  21.99 
 
 
1690 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
441 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  31.21 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>