171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4670 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
439 aa  831    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  69.93 
 
 
444 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  69.04 
 
 
437 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  69.46 
 
 
473 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  67.96 
 
 
444 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  67.76 
 
 
432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 
436 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  53.92 
 
 
437 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  53.9 
 
 
440 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  54.57 
 
 
434 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  55.81 
 
 
460 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  55.45 
 
 
437 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  55.45 
 
 
437 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  54.82 
 
 
446 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  55.88 
 
 
471 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  55.68 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  55.2 
 
 
469 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  54.37 
 
 
464 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  53.17 
 
 
441 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  55.58 
 
 
499 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  56.06 
 
 
438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  53.08 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  52.61 
 
 
445 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  55.81 
 
 
440 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  55.77 
 
 
450 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  42.73 
 
 
451 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  42.28 
 
 
451 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  42.06 
 
 
451 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
439 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  42.5 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  43.09 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  42.51 
 
 
451 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  42.95 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
414 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  41.15 
 
 
436 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
447 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  42.56 
 
 
453 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 
441 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
475 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
412 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
421 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  39.44 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  41.5 
 
 
414 aa  320  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  41.22 
 
 
413 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
459 aa  316  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  38.93 
 
 
490 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  41.61 
 
 
484 aa  266  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.16 
 
 
432 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.12 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.18 
 
 
1041 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.6 
 
 
1015 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.78 
 
 
937 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.51 
 
 
863 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.78 
 
 
937 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.5 
 
 
892 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  35.91 
 
 
508 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.32 
 
 
307 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.22 
 
 
1263 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.84 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.38 
 
 
757 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.92 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.49 
 
 
482 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.29 
 
 
867 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  33.54 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.33 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.3 
 
 
886 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.58 
 
 
761 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.01 
 
 
1107 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.22 
 
 
305 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.34 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.79 
 
 
653 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.89 
 
 
476 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.81 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.82 
 
 
1024 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.17 
 
 
1344 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  34.38 
 
 
1498 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  42.48 
 
 
1393 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0369869 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  32.43 
 
 
675 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.84 
 
 
1749 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  32.14 
 
 
791 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.71 
 
 
615 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.28 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
1281 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  26.99 
 
 
802 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  36.65 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.34 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  32.81 
 
 
854 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1553  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.1 
 
 
630 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  19.13 
 
 
204 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  35 
 
 
478 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  32.86 
 
 
1498 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.85 
 
 
2132 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  23.34 
 
 
1053 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  27.42 
 
 
980 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.54 
 
 
972 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.47 
 
 
755 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  32.04 
 
 
149 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  25.55 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>