141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2000 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  40.68 
 
 		 1473 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  80.71 
 
 		 1497 aa  2366    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  80.51 
 
 		 1496 aa  2335    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  40.94 
 
 		 1473 aa  868    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 1498 aa  2997    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  81.11 
 
 		 1498 aa  2385    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  48.32 
 
 		 1495 aa  1201    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1395 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  29.43 
 
 		 1395 aa  483  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1631 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1494 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1393 aa  460  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1439 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1459 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1611 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1376 aa  397  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1508 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1481 aa  354  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1481 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1744 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  25.63 
 
 		 1984 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1990 aa  269  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1847 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.37 
 
 		 1634 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1262 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1593 aa  224  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1275 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1690 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1680 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1625 aa  185  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.38 
 
 		 2580 aa  184  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1640 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1489 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1608 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  24.47 
 
 		 971 aa  108  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  29.12 
 
 		 568 aa  100  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  27.56 
 
 		 545 aa  94.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  27.01 
 
 		 565 aa  92.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  26.4 
 
 		 574 aa  92.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  26.21 
 
 		 575 aa  89.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  27 
 
 		 583 aa  89.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  27.86 
 
 		 603 aa  87  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  26.84 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  28.09 
 
 		 547 aa  84.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  23.29 
 
 		 622 aa  75.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.28 
 
 		 1107 aa  74.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.06 
 
 		 482 aa  74.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  23.61 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  24.55 
 
 		 755 aa  72  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  23.65 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  24.32 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.06 
 
 		 776 aa  71.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  23.65 
 
 		 731 aa  70.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  23.65 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  24.11 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  25.74 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  24.51 
 
 		 765 aa  68.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  29.88 
 
 		 448 aa  63.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 1041 aa  63.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.43 
 
 		 354 aa  61.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 453 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 445 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 447 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 445 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.77 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.65 
 
 		 1263 aa  59.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  29.3 
 
 		 436 aa  58.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.57 
 
 		 451 aa  58.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  58.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 439 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 447 aa  57  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.56 
 
 		 414 aa  56.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  31.65 
 
 		 447 aa  56.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26.78 
 
 		 867 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27.22 
 
 		 307 aa  56.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 469 aa  55.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  21.04 
 
 		 928 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 471 aa  55.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  27.93 
 
 		 1015 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.19 
 
 		 467 aa  55.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.3 
 
 		 451 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 436 aa  54.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 440 aa  54.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.3 
 
 		 451 aa  53.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 437 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  22.07 
 
 		 928 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 437 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 437 aa  52.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  31.82 
 
 		 490 aa  52.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.76 
 
 		 980 aa  52.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 450 aa  52.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 444 aa  52.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 460 aa  52  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 464 aa  52  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>