53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0436 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1847 aa  3750    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  31.22 
 
 		 1990 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  30.47 
 
 		 1984 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1593 aa  283  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1497 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1439 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1498 aa  259  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1439 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1496 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1498 aa  244  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1494 aa  238  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1631 aa  229  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1393 aa  228  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.15 
 
 		 1634 aa  226  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1262 aa  224  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  29.82 
 
 		 2580 aa  220  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1495 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1459 aa  211  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1395 aa  208  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1395 aa  208  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1275 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1608 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1481 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1481 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1625 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1473 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1473 aa  185  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1489 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1640 aa  178  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1690 aa  172  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1680 aa  171  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1508 aa  158  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1611 aa  154  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1744 aa  148  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  26.06 
 
 		 971 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1376 aa  108  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  26.46 
 
 		 482 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.87 
 
 		 1107 aa  57  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  26.42 
 
 		 1041 aa  57.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.52 
 
 		 1263 aa  52.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  27.65 
 
 		 416 aa  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27.98 
 
 		 307 aa  51.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  26.89 
 
 		 1015 aa  50.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 1281 aa  49.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.95 
 
 		 863 aa  50.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1349  hypothetical protein  28.24 
 
 		 634 aa  49.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  22.76 
 
 		 568 aa  48.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.1 
 
 		 305 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.19 
 
 		 354 aa  48.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  24.34 
 
 		 622 aa  47.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  23.64 
 
 		 615 aa  47  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  22.93 
 
 		 788 aa  45.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  34 
 
 		 2132 aa  45.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>