46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1302 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  75.16 
 
 		 1984 aa  3063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1990 aa  4034    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  29.57 
 
 		 2580 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  31.38 
 
 		 1847 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1631 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.37 
 
 		 1634 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1640 aa  363  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1611 aa  350  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1625 aa  284  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1497 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1498 aa  270  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1498 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1593 aa  259  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1690 aa  255  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1680 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1262 aa  228  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1439 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1439 aa  228  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1275 aa  216  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1393 aa  209  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1489 aa  196  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1496 aa  195  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1608 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1459 aa  192  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1495 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1395 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1395 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1494 aa  169  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1481 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.44 
 
 		 971 aa  159  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1508 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1481 aa  158  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1744 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1376 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1473 aa  153  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1473 aa  143  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  23.45 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  22.55 
 
 		 574 aa  60.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  22.34 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  24.02 
 
 		 603 aa  57.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  22.54 
 
 		 443 aa  56.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  24.18 
 
 		 575 aa  56.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  23.66 
 
 		 583 aa  55.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.25 
 
 		 547 aa  53.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  24.16 
 
 		 565 aa  53.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.53 
 
 		 1107 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>