59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2340 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 1608 aa  3211    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1439 aa  278  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1439 aa  275  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1489 aa  249  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1494 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1593 aa  240  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1262 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1393 aa  233  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1481 aa  230  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1481 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1376 aa  227  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1498 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1395 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1275 aa  218  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.51 
 
 		 1984 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1395 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1847 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1744 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1497 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1625 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1459 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1990 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1496 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1495 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1690 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1631 aa  193  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1680 aa  192  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1508 aa  189  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.1 
 
 		 1634 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1473 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1473 aa  164  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  24.96 
 
 		 2580 aa  162  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1640 aa  136  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1611 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1498 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.92 
 
 		 971 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.73 
 
 		 508 aa  67  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30 
 
 		 892 aa  57  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.77 
 
 		 1107 aa  55.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.26 
 
 		 354 aa  53.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.82 
 
 		 565 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.83 
 
 		 1266 aa  52.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.36 
 
 		 476 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.96 
 
 		 1344 aa  50.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.4 
 
 		 760 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.89 
 
 		 779 aa  50.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  23.68 
 
 		 1749 aa  49.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.89 
 
 		 765 aa  49.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  27.44 
 
 		 1015 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.31 
 
 		 755 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  27.31 
 
 		 766 aa  48.9  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.49 
 
 		 772 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.89 
 
 		 542 aa  48.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.2 
 
 		 760 aa  47  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.18 
 
 		 766 aa  46.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  33.75 
 
 		 776 aa  46.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  25.43 
 
 		 972 aa  46.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.71 
 
 		 1263 aa  45.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  24.46 
 
 		 2132 aa  45.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>