36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4562 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  100 
 
 		 971 aa  1991    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1593 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1640 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  28.64 
 
 		 1984 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1611 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1990 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1393 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1625 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1631 aa  151  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.96 
 
 		 2580 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1459 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1439 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1489 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1439 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1744 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  24.95 
 
 		 1634 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1680 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1395 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1275 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1395 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1262 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1376 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1847 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1496 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1497 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1498 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1481 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1494 aa  101  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1498 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1481 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1608 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1495 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1508 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1473 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1473 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>