52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2924 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  42.58 
 
 		 1275 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 1262 aa  2538    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  30.98 
 
 		 1489 aa  310  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1690 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1680 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1439 aa  294  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  32.15 
 
 		 1625 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1439 aa  280  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1593 aa  265  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1395 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1395 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1459 aa  251  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  28.98 
 
 		 1634 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  27.64 
 
 		 1984 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1393 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1494 aa  238  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1631 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1497 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1473 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1495 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1481 aa  228  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1990 aa  227  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1498 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1608 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1498 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1744 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1481 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1847 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.28 
 
 		 1496 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1508 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  31.38 
 
 		 1473 aa  211  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  29 
 
 		 1640 aa  196  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  26.25 
 
 		 2580 aa  194  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1611 aa  184  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  24.82 
 
 		 971 aa  125  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1376 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.28 
 
 		 1041 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.37 
 
 		 1107 aa  56.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.39 
 
 		 508 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.79 
 
 		 653 aa  51.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  32.08 
 
 		 615 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.32 
 
 		 863 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.83 
 
 		 414 aa  49.3  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.37 
 
 		 2132 aa  48.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 412 aa  48.9  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  25.27 
 
 		 396 aa  47.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.58 
 
 		 476 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.01 
 
 		 307 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  25.15 
 
 		 2198 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.82 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.28 
 
 		 1015 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  29.51 
 
 		 509 aa  45.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>