87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3301 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1495 aa  967    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1498 aa  902    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  93.89 
 
 		 1473 aa  2720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  41.19 
 
 		 1497 aa  931    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1473 aa  2964    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  41.55 
 
 		 1498 aa  936    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  41.23 
 
 		 1496 aa  926    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1393 aa  393  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1395 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1395 aa  387  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1494 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1439 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1459 aa  355  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1439 aa  353  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.51 
 
 		 1634 aa  321  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1508 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1481 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.28 
 
 		 1481 aa  308  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1744 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1275 aa  272  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1262 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1593 aa  249  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1376 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1690 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1847 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1680 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1625 aa  195  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1631 aa  190  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1611 aa  189  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.44 
 
 		 2580 aa  188  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1608 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  27.29 
 
 		 1984 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1640 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1990 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1489 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  23.09 
 
 		 971 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  26.94 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  24.66 
 
 		 603 aa  77  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  24.44 
 
 		 565 aa  74.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  27.03 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  23.73 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  23.23 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.73 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  24.36 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  23.11 
 
 		 545 aa  66.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  26.44 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  23.61 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  26.73 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.15 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.51 
 
 		 1263 aa  62  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  26.32 
 
 		 788 aa  62  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  26.47 
 
 		 788 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  26.47 
 
 		 788 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.65 
 
 		 1749 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.5 
 
 		 1344 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  34.44 
 
 		 1266 aa  57.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 421 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.06 
 
 		 1041 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.46 
 
 		 925 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.57 
 
 		 892 aa  53.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 414 aa  53.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.74 
 
 		 508 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.14 
 
 		 1015 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.52 
 
 		 307 aa  52.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.7 
 
 		 1107 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 444 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 439 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 444 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.09 
 
 		 467 aa  50.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.46 
 
 		 416 aa  50.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  49.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.1 
 
 		 863 aa  49.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  29.17 
 
 		 438 aa  48.5  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.57 
 
 		 980 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 450 aa  48.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  27.47 
 
 		 436 aa  48.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.37 
 
 		 414 aa  48.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.35 
 
 		 757 aa  48.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 445 aa  47.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 451 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.3 
 
 		 2132 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 432 aa  47  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  35.56 
 
 		 559 aa  46.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  26.47 
 
 		 766 aa  45.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.52 
 
 		 374 aa  45.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  25.49 
 
 		 432 aa  45.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>