105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0087 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  79.14 
 
 		 443 aa  686    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  72.05 
 
 		 547 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  70.18 
 
 		 583 aa  764    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  69.31 
 
 		 568 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  62.56 
 
 		 603 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  100 
 
 		 575 aa  1179    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  72.47 
 
 		 565 aa  805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  70.36 
 
 		 574 aa  746    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  68.62 
 
 		 545 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  39.62 
 
 		 615 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  43.65 
 
 		 788 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  43.65 
 
 		 788 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  43.65 
 
 		 788 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  38.47 
 
 		 622 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  38.27 
 
 		 755 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  38.27 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  38.27 
 
 		 755 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  41.4 
 
 		 776 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.56 
 
 		 755 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.3 
 
 		 765 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  35.38 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  40.51 
 
 		 388 aa  123  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  32.17 
 
 		 375 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  35.74 
 
 		 301 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  30.93 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  42.07 
 
 		 581 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  36.82 
 
 		 284 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1495 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1498 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1611 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 763 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1494 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1481 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  31.71 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  32.52 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1481 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1439 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  31.97 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1473 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1497 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1459 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1439 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1473 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  25.3 
 
 		 1984 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1640 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1496 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1395 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1498 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1395 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1393 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  25.49 
 
 		 1634 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1631 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1376 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.56 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.09 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1508 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.9 
 
 		 565 aa  57  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1990 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1744 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.58 
 
 		 863 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.73 
 
 		 1015 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.99 
 
 		 1041 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  29.49 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 441 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.5 
 
 		 892 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  29.24 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 437 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.45 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.57 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  28.19 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  30.21 
 
 		 436 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.79 
 
 		 761 aa  47.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 412 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  27.42 
 
 		 193 aa  47.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 445 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.82 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.44 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.76 
 
 		 713 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 459 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  27.85 
 
 		 489 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.54 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  26.3 
 
 		 886 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1680 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 464 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  29.78 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.49 
 
 		 867 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 509 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  28.9 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>