42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1703 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  843    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  92.71 
 
 		 443 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  92.71 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  92.71 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  92.71 
 
 		 443 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  94.05 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  30 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  29.72 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  29.7 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  31.64 
 
 		 816 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.12 
 
 		 1679 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1059 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  31.33 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  24.75 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1389 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  30.51 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  29.03 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  28.97 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  28.98 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  30.67 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  36.49 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  28.39 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  29.61 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  25.49 
 
 		 631 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  30.24 
 
 		 545 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  32.58 
 
 		 615 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.91 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  30.14 
 
 		 284 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  32.34 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  26.07 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  31.07 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  27.38 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  31.43 
 
 		 273 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  28.91 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  21.05 
 
 		 755 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.58 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.17 
 
 		 2198 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>