118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2774 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  100 
 
 
375 aa  747    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  60.27 
 
 
323 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  35.99 
 
 
622 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  35.53 
 
 
615 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  46.67 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  42.68 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  44.29 
 
 
301 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  43.84 
 
 
776 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  31.69 
 
 
575 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  30.33 
 
 
583 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  44.29 
 
 
388 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.77 
 
 
755 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  25.86 
 
 
731 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  25.86 
 
 
755 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  25.86 
 
 
755 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  29.51 
 
 
547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  29.22 
 
 
568 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  30.39 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  25.4 
 
 
765 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  29.09 
 
 
545 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  29.46 
 
 
603 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  36.1 
 
 
788 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  36.1 
 
 
788 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  36.1 
 
 
788 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.55 
 
 
1107 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  28.69 
 
 
574 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.61 
 
 
1041 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  39.29 
 
 
1015 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.2 
 
 
863 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.07 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  39.13 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  39.31 
 
 
892 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.55 
 
 
1263 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  33.51 
 
 
763 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  36.31 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  32.16 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.62 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.76 
 
 
886 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  27.86 
 
 
443 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.65 
 
 
937 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.65 
 
 
937 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.27 
 
 
508 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.73 
 
 
867 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30.3 
 
 
1749 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  29.21 
 
 
1481 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  31.73 
 
 
435 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.18 
 
 
354 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.56 
 
 
1395 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  29.21 
 
 
1481 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  27.15 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  32 
 
 
713 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  37.5 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.36 
 
 
1344 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  29.51 
 
 
523 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.73 
 
 
1024 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  26.7 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
447 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.91 
 
 
779 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  32.37 
 
 
1395 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.91 
 
 
542 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.91 
 
 
765 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
475 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  31.55 
 
 
419 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.82 
 
 
772 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  26.44 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  33.33 
 
 
766 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.38 
 
 
757 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.24 
 
 
1351 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.11 
 
 
1744 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  29.48 
 
 
410 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.93 
 
 
2132 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  32.85 
 
 
1508 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  28.77 
 
 
692 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.67 
 
 
761 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  27.63 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.38 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.62 
 
 
476 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  28.64 
 
 
1494 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.46 
 
 
760 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  31.18 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  28.82 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  34.03 
 
 
418 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  27.89 
 
 
2580 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  26.03 
 
 
690 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.48 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.33 
 
 
1679 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.93 
 
 
1496 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.64 
 
 
1498 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2316  hypothetical protein  31.39 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  32.33 
 
 
766 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.59 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  34.91 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  23.98 
 
 
1498 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  30.67 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  30.39 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>