64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32564 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  100 
 
 
692 aa  1392    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.44 
 
 
1266 aa  83.2  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  27.71 
 
 
523 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  28.21 
 
 
757 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.94 
 
 
1041 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  33.7 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  27.79 
 
 
630 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  30.11 
 
 
788 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  30.11 
 
 
788 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  30.11 
 
 
788 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.62 
 
 
1344 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 
615 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.35 
 
 
1351 aa  54.3  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  30.5 
 
 
384 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 
301 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
450 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.5 
 
 
1015 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  29.3 
 
 
479 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.81 
 
 
863 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
445 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.18 
 
 
355 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.05 
 
 
1112 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  30.05 
 
 
1070 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  30.05 
 
 
1070 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.47 
 
 
1107 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  34.83 
 
 
284 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  30.65 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  31.33 
 
 
755 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  29.19 
 
 
731 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.3 
 
 
434 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 
755 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.91 
 
 
640 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.51 
 
 
755 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29338  predicted protein  26.38 
 
 
440 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196261  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  33.85 
 
 
375 aa  47.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
473 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  32.82 
 
 
692 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
412 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  36.89 
 
 
993 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.86 
 
 
1088 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  35.71 
 
 
622 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  30.77 
 
 
586 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.88 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31744  predicted protein  25.83 
 
 
672 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743293  normal  0.568196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.41 
 
 
779 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
437 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
437 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
441 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  27.69 
 
 
994 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  30.72 
 
 
765 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.41 
 
 
765 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  32.6 
 
 
318 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.41 
 
 
542 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.23 
 
 
766 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.23 
 
 
755 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
445 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.41 
 
 
772 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
444 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  29.65 
 
 
647 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  24.63 
 
 
509 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
444 aa  44.3  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.86 
 
 
760 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  25.26 
 
 
719 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.55505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>