158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2582 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  99.37 
 
 		 788 aa  1605    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1612    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  76.49 
 
 		 776 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  99.62 
 
 		 788 aa  1607    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  40.91 
 
 		 755 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  41.72 
 
 		 731 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  40.91 
 
 		 755 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  41.61 
 
 		 755 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  39.9 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  44.95 
 
 		 574 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  37.14 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  43.97 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  42.72 
 
 		 615 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  40.73 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  43.65 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  35.43 
 
 		 603 aa  360  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  41.99 
 
 		 568 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  41.21 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  41.36 
 
 		 547 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  43.91 
 
 		 443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  91.55 
 
 		 322 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  90.14 
 
 		 322 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  45.92 
 
 		 581 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  38.46 
 
 		 301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  36.02 
 
 		 318 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  33.63 
 
 		 388 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  40.79 
 
 		 763 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  41.64 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  41.96 
 
 		 1041 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  37.66 
 
 		 863 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.82 
 
 		 1015 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  36.1 
 
 		 375 aa  96.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.6 
 
 		 416 aa  90.9  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1393 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  29.88 
 
 		 323 aa  87.8  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.67 
 
 		 1107 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.43 
 
 		 1263 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.64 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1395 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.8 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1459 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1439 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1439 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  26.36 
 
 		 379 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.58 
 
 		 892 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  31.28 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1611 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1494 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.12 
 
 		 867 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1376 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1395 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.05 
 
 		 1266 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.17 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  29.34 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.36 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.21 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  36.21 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.23 
 
 		 937 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.46 
 
 		 937 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  29.79 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1497 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  35.34 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  34.66 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  35.34 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  35.34 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1495 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.23 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1481 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1473 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1508 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  34.48 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.82 
 
 		 1024 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1481 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  40.61 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  34.17 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1473 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1498 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  32.1 
 
 		 1749 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  30.11 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  28.98 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 886 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.19 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  33.86 
 
 		 535 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.01 
 
 		 1679 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 440 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1640 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1496 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1744 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  32.28 
 
 		 713 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.97 
 
 		 242 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1498 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 453 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 445 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 464 aa  54.7  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  28.22 
 
 		 539 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  29.94 
 
 		 432 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>