207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1833 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  100 
 
 		 476 aa  972    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  39.56 
 
 		 472 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.06 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.85 
 
 		 1041 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.51 
 
 		 892 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.69 
 
 		 1107 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.66 
 
 		 1263 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.7 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.41 
 
 		 863 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.24 
 
 		 354 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.95 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.78 
 
 		 867 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33 
 
 		 886 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.97 
 
 		 713 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.81 
 
 		 937 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.98 
 
 		 1015 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.81 
 
 		 937 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.02 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.25 
 
 		 242 aa  97.8  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.64 
 
 		 307 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.62 
 
 		 1749 aa  94  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.21 
 
 		 1024 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.45 
 
 		 1344 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.68 
 
 		 757 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  32.14 
 
 		 2491 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.61 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.11 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.17 
 
 		 761 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  32.67 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  29.7 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  29.03 
 
 		 972 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  24.87 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.62 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  29.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  30.51 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  26.25 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  26.51 
 
 		 1088 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  35.56 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.41 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  33.96 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  30.57 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.52 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  30.43 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.3 
 
 		 490 aa  67  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.31 
 
 		 2132 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  30.06 
 
 		 2324 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1744 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.75 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  29 
 
 		 925 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  26.52 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.19 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  32.48 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  35.2 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  27.23 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.53 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.1 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  29.39 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  30.82 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  27.05 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.87 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.78 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  27.9 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  28.24 
 
 		 1012 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  28.03 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  30.99 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  28.57 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.43 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  25.13 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  26.94 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  24.29 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  30.26 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  24.92 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  26.34 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  31.63 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>