98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12909 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  100 
 
 
258 aa  497  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  39.06 
 
 
2491 aa  151  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  35.5 
 
 
716 aa  145  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  37.97 
 
 
1012 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  33.73 
 
 
685 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  32.33 
 
 
526 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  35.32 
 
 
304 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  35.85 
 
 
601 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  37.16 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  37.79 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  36.36 
 
 
587 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  32.88 
 
 
304 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  28.57 
 
 
1017 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  32.13 
 
 
350 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  35.34 
 
 
247 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  41.18 
 
 
169 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.89 
 
 
1041 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  29.36 
 
 
283 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  28.23 
 
 
263 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  33.21 
 
 
447 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  33.19 
 
 
640 aa  92  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  32.38 
 
 
497 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  29.66 
 
 
334 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  37.1 
 
 
1263 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  31.82 
 
 
454 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.12 
 
 
1107 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.46 
 
 
354 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.75 
 
 
1000 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.88 
 
 
713 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  28.99 
 
 
899 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.65 
 
 
482 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  32.2 
 
 
4500 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  41.6 
 
 
633 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  33.52 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  33.7 
 
 
890 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  37.16 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  32.88 
 
 
768 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.65 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  30.65 
 
 
593 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  39.1 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.45 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.63 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  32.77 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  33.33 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  28.1 
 
 
512 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.1 
 
 
508 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.78 
 
 
892 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  42.31 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  33.95 
 
 
461 aa  68.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.67 
 
 
863 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  32.34 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  32.33 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  33.82 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  40.2 
 
 
1015 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  33.83 
 
 
682 aa  65.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  34.58 
 
 
127 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.46 
 
 
1749 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.47 
 
 
757 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.84 
 
 
886 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  25.8 
 
 
596 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  35.36 
 
 
867 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.44 
 
 
648 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
436 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.77 
 
 
972 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.05 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  36.19 
 
 
2324 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  42.37 
 
 
81 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.23 
 
 
937 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.23 
 
 
937 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  26.85 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.07 
 
 
761 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  31.97 
 
 
1498 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 
840 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.76 
 
 
1395 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
439 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
451 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  30.36 
 
 
1395 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.01 
 
 
1024 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  22.76 
 
 
472 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.43 
 
 
451 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  28.39 
 
 
791 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  25.78 
 
 
1290 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.7 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  31.58 
 
 
1494 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.19 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  30.97 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  30.06 
 
 
478 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
412 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
445 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  33.62 
 
 
1088 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  30.86 
 
 
1473 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.54 
 
 
1344 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.51 
 
 
447 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  30.16 
 
 
396 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  29.84 
 
 
1497 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 
744 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  35.56 
 
 
443 aa  42  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>