87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4344 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  100 
 
 
169 aa  328  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  38.36 
 
 
1012 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  36.09 
 
 
2491 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  37.42 
 
 
304 aa  97.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  34.97 
 
 
1017 aa  95.5  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  37.72 
 
 
526 aa  94.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  36.02 
 
 
716 aa  93.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  32.93 
 
 
249 aa  93.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  40.6 
 
 
1000 aa  92.8  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  37.16 
 
 
348 aa  92.8  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  41.18 
 
 
258 aa  91.3  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  38.41 
 
 
230 aa  90.9  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  33.33 
 
 
263 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  33.54 
 
 
304 aa  89  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  37.35 
 
 
601 aa  86.3  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  40 
 
 
350 aa  86.3  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  35.54 
 
 
685 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  35.37 
 
 
237 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  35.5 
 
 
283 aa  84.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  36.02 
 
 
447 aa  81.3  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  33.85 
 
 
222 aa  80.9  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  38.16 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  34.27 
 
 
899 aa  79  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  34.15 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  44.34 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  33.33 
 
 
890 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  32.09 
 
 
497 aa  74.7  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  31.51 
 
 
454 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  27.68 
 
 
454 aa  72  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  31.21 
 
 
4500 aa  71.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  30.08 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  31.17 
 
 
540 aa  68.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  31.52 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  35.29 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.29 
 
 
863 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  30.25 
 
 
768 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.21 
 
 
892 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  26.47 
 
 
640 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  32.35 
 
 
596 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  37.37 
 
 
2324 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.74 
 
 
543 aa  61.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  28.48 
 
 
633 aa  61.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.35 
 
 
937 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.3 
 
 
416 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.12 
 
 
867 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.29 
 
 
1041 aa  58.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.71 
 
 
354 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.13 
 
 
1107 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.81 
 
 
937 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.42 
 
 
648 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  33.98 
 
 
329 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  26.79 
 
 
593 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.08 
 
 
1749 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.49 
 
 
482 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.54 
 
 
1015 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
840 aa  51.6  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.45 
 
 
886 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
460 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
445 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.54 
 
 
1263 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.56 
 
 
508 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
436 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.38 
 
 
467 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  29.17 
 
 
512 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  37.14 
 
 
291 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  36.71 
 
 
81 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  30.97 
 
 
394 aa  47.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.27 
 
 
476 aa  47.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.67 
 
 
307 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.06 
 
 
447 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
1290 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 
296 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.22 
 
 
472 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.77 
 
 
757 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
475 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  32.48 
 
 
1024 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  25.6 
 
 
682 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
444 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.57 
 
 
413 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  29.01 
 
 
569 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
447 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.7 
 
 
972 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.41 
 
 
434 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  29.93 
 
 
451 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.93 
 
 
713 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 
473 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.2 
 
 
451 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>