93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_1379 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  100 
 
 
350 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  33.8 
 
 
899 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  35.11 
 
 
334 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  32.53 
 
 
2491 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  32.13 
 
 
526 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  28.82 
 
 
601 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  30.29 
 
 
304 aa  123  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  28.53 
 
 
640 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  29.22 
 
 
716 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  30.33 
 
 
685 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  29.37 
 
 
283 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  31.47 
 
 
1012 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  34.13 
 
 
247 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  29.74 
 
 
263 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  30.8 
 
 
249 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.4 
 
 
1107 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  31.27 
 
 
304 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  32.13 
 
 
258 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  31.44 
 
 
587 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  29.41 
 
 
1017 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  31.47 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.4 
 
 
1041 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  29.41 
 
 
890 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  28.9 
 
 
447 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  40.13 
 
 
169 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  34.29 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  35.44 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  26.39 
 
 
596 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  27.12 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.84 
 
 
1015 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  28.41 
 
 
497 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  26.75 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  26.89 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.79 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  36.81 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.07 
 
 
648 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.42 
 
 
937 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.52 
 
 
863 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.42 
 
 
937 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  35.65 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  36.15 
 
 
1000 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  25.99 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  32.35 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.53 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.25 
 
 
867 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  29.9 
 
 
4500 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  38.68 
 
 
2324 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.44 
 
 
892 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.47 
 
 
416 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.67 
 
 
1263 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  26.88 
 
 
593 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.8 
 
 
1024 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  29.17 
 
 
633 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.84 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.39 
 
 
886 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.34 
 
 
434 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  26.55 
 
 
682 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.55 
 
 
757 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 
840 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.05 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.03 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  37.42 
 
 
448 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.69 
 
 
293 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
447 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  23.89 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.68 
 
 
972 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.37 
 
 
713 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.15 
 
 
1749 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.43 
 
 
467 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 
475 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.28 
 
 
1344 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  50.88 
 
 
675 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.87 
 
 
476 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  35.8 
 
 
81 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27.46 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.45 
 
 
474 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 
447 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.27 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  27.18 
 
 
768 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  27.51 
 
 
569 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  36.3 
 
 
528 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  24.36 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  31.73 
 
 
478 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  32.67 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  26.77 
 
 
772 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  27.52 
 
 
446 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6692  predicted protein  27.98 
 
 
252 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283968  hitchhiker  0.00751266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  32.08 
 
 
1498 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>