78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4339 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  35.38 
 
 
2491 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.56 
 
 
247 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  32.21 
 
 
283 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  34.42 
 
 
1012 aa  94.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  28 
 
 
454 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  34.62 
 
 
601 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  36.65 
 
 
304 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  29.87 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  30.25 
 
 
716 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  27.2 
 
 
454 aa  88.6  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  34.3 
 
 
526 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  29.34 
 
 
587 aa  85.9  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  32.06 
 
 
304 aa  84.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  30.43 
 
 
633 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  29.03 
 
 
685 aa  82  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  35.26 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  33.85 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  30.94 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.27 
 
 
1017 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  31.58 
 
 
350 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.61 
 
 
1000 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  37.98 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  26.48 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  25.11 
 
 
4500 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.02 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  28.24 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  34.78 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  27.24 
 
 
596 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  31.5 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  32.8 
 
 
899 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  31.22 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  29.27 
 
 
890 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  27.73 
 
 
682 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  29.31 
 
 
640 aa  65.5  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  29.88 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.9 
 
 
757 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.68 
 
 
482 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.9 
 
 
1041 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.49 
 
 
863 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  27.43 
 
 
497 aa  61.6  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  37.07 
 
 
416 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  29.91 
 
 
768 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30.22 
 
 
1749 aa  59.7  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  37.09 
 
 
886 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.03 
 
 
543 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.54 
 
 
867 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  35.43 
 
 
508 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.88 
 
 
1263 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.8 
 
 
2324 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.23 
 
 
1107 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.71 
 
 
937 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  34.07 
 
 
461 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.02 
 
 
296 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  34.75 
 
 
168 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.84 
 
 
1015 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.71 
 
 
648 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  28.25 
 
 
593 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.98 
 
 
1024 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  23.27 
 
 
512 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  24.89 
 
 
344 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.82 
 
 
354 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  31.43 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.08 
 
 
761 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  34.78 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.1 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  34.95 
 
 
791 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.96 
 
 
476 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.91 
 
 
1744 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.96 
 
 
713 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  31.07 
 
 
329 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.63 
 
 
472 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27.2 
 
 
307 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  31.25 
 
 
81 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  31.52 
 
 
443 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.94 
 
 
972 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  40.79 
 
 
675 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>