140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_107 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  100 
 
 
601 aa  1154    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  32.29 
 
 
526 aa  211  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  33.79 
 
 
2491 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  29.03 
 
 
1012 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  31.91 
 
 
447 aa  163  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.38 
 
 
482 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  35.16 
 
 
304 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  30.18 
 
 
587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.15 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  31.01 
 
 
716 aa  137  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  34.34 
 
 
249 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  29.15 
 
 
685 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  31.91 
 
 
350 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  30.82 
 
 
1017 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  30.27 
 
 
263 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  34.74 
 
 
283 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  27.96 
 
 
640 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.7 
 
 
247 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  30.82 
 
 
304 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  29.58 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  29.92 
 
 
899 aa  113  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.73 
 
 
757 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.58 
 
 
1041 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.41 
 
 
1107 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.42 
 
 
1263 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  35.85 
 
 
258 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.24 
 
 
354 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  36.72 
 
 
230 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  29.59 
 
 
454 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  34.62 
 
 
222 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.89 
 
 
416 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  29.51 
 
 
890 aa  87.8  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.28 
 
 
543 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.86 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  28.43 
 
 
596 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  37.35 
 
 
169 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  26.65 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.29 
 
 
863 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.19 
 
 
1000 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.11 
 
 
892 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  35.33 
 
 
237 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  30.5 
 
 
633 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  33.66 
 
 
648 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.29 
 
 
1749 aa  81.6  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.23 
 
 
1024 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  32.38 
 
 
713 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  31.29 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  27.03 
 
 
2324 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.13 
 
 
867 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  31.28 
 
 
593 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  30.3 
 
 
4500 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  36.26 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.33 
 
 
1344 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  31.82 
 
 
127 aa  74.3  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  30.72 
 
 
168 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.16 
 
 
886 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  28.84 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  28.9 
 
 
682 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  33.06 
 
 
768 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.52 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.25 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.7 
 
 
296 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  31.79 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  44.44 
 
 
81 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 
1015 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  25.57 
 
 
512 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.75 
 
 
559 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.94 
 
 
755 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.05 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  28.37 
 
 
760 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  28.94 
 
 
766 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.1 
 
 
972 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  29.81 
 
 
772 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  29.44 
 
 
569 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  29.57 
 
 
1290 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.62 
 
 
760 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.8 
 
 
242 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.77 
 
 
2132 aa  57.4  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
447 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.56 
 
 
307 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
447 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  28.73 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.88 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  31.78 
 
 
329 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.85 
 
 
447 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.09 
 
 
765 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  31.19 
 
 
802 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  28.09 
 
 
779 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  28.91 
 
 
656 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.68 
 
 
542 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  33.14 
 
 
451 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
445 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
444 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>