147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05354 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  100 
 
 		 648 aa  1284    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.87 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  34.9 
 
 		 656 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.73 
 
 		 1263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.41 
 
 		 482 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.72 
 
 		 354 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.11 
 
 		 1024 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.27 
 
 		 1041 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.84 
 
 		 713 aa  98.6  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.65 
 
 		 1107 aa  97.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.08 
 
 		 867 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  32.89 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.33 
 
 		 508 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 886 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.15 
 
 		 892 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  40.21 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.06 
 
 		 863 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.47 
 
 		 296 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.3 
 
 		 937 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  33.66 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.3 
 
 		 937 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  36.17 
 
 		 242 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  36.52 
 
 		 972 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  28.37 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  37.93 
 
 		 761 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.17 
 
 		 307 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  26.3 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  26.44 
 
 		 350 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  34.34 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  35.56 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.74 
 
 		 1015 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  27.75 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  27.55 
 
 		 1012 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.18 
 
 		 1749 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  24.71 
 
 		 2491 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  26.25 
 
 		 716 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  38.19 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  26.37 
 
 		 802 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  30.86 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  30.16 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  37.78 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.39 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  32.39 
 
 		 791 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  40.7 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  31.13 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  26.26 
 
 		 685 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.79 
 
 		 2324 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.03 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  39.64 
 
 		 675 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  32.8 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  28.64 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  32.44 
 
 		 1494 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  30.71 
 
 		 1017 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  28.28 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.93 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.42 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.19 
 
 		 1000 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  28.72 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  31.01 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  25.95 
 
 		 1088 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  28.23 
 
 		 890 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  23.08 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  32.26 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.75 
 
 		 1344 aa  57.4  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.22 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  27.62 
 
 		 283 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  36.94 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  24.06 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.8 
 
 		 446 aa  56.6  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  26.42 
 
 		 169 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 		 744 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.93 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  33.11 
 
 		 293 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 460 aa  54.7  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1744 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 453 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.88 
 
 		 305 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  26.87 
 
 		 569 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 436 aa  54.3  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.24 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  35.16 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>