84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0676 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  100 
 
 		 284 aa  554  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  78.02 
 
 		 615 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  76.56 
 
 		 301 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  71.48 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  70.07 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  37.63 
 
 		 755 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  37.63 
 
 		 755 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  37.63 
 
 		 731 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.63 
 
 		 755 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.61 
 
 		 765 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  42.68 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  41.64 
 
 		 788 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  41.64 
 
 		 788 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  41.26 
 
 		 788 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  42.56 
 
 		 776 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  41.2 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  38.37 
 
 		 583 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  37.55 
 
 		 568 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  40 
 
 		 545 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  35 
 
 		 603 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  33.33 
 
 		 547 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  37.44 
 
 		 575 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  37.8 
 
 		 565 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  35.83 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  43.3 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  41.92 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.63 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.39 
 
 		 763 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.9 
 
 		 1015 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.46 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.81 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.88 
 
 		 713 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.08 
 
 		 1263 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.03 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.66 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.98 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  44.44 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.08 
 
 		 482 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.63 
 
 		 892 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 		 447 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.44 
 
 		 1679 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 		 441 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.39 
 
 		 354 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 421 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.05 
 
 		 472 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  31.36 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.41 
 
 		 867 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  22.43 
 
 		 379 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  34.83 
 
 		 692 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 437 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  35.46 
 
 		 447 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  26.04 
 
 		 379 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  32.66 
 
 		 450 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.8 
 
 		 886 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  36.88 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.83 
 
 		 1344 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  27.49 
 
 		 410 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.3 
 
 		 631 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.95 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  30.15 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.17 
 
 		 1749 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  26.9 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  34.09 
 
 		 446 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.05 
 
 		 484 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.37 
 
 		 1107 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 441 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.77 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.6 
 
 		 761 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 451 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 444 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 469 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.95 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  33.33 
 
 		 451 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 471 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  33.56 
 
 		 451 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 439 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  33.97 
 
 		 434 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  24.35 
 
 		 384 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>