100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2110 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  71.28 
 
 		 583 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  74.78 
 
 		 547 aa  828    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 568 aa  1161    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  78.94 
 
 		 443 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  66.04 
 
 		 603 aa  713    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  69.31 
 
 		 575 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  72.76 
 
 		 565 aa  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  69.42 
 
 		 574 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  77.99 
 
 		 545 aa  877    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  40.95 
 
 		 615 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  38.63 
 
 		 755 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  38.63 
 
 		 731 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  38.63 
 
 		 755 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  42.75 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  39.8 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  41.48 
 
 		 776 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  41.99 
 
 		 788 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  41.99 
 
 		 788 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  41.99 
 
 		 788 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.41 
 
 		 765 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  37.46 
 
 		 318 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  44.29 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  39.16 
 
 		 301 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  32.84 
 
 		 323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  37.55 
 
 		 284 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.16 
 
 		 581 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.22 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1459 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1495 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  35.84 
 
 		 763 aa  93.6  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1498 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1611 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  35.83 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1494 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1497 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1496 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1498 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1640 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  27.17 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1376 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1439 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1481 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1439 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1481 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1473 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1473 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  27.17 
 
 		 379 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.63 
 
 		 1041 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1744 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1393 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1395 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1395 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.26 
 
 		 1634 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  30.89 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.55 
 
 		 863 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  25.07 
 
 		 1984 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.34 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  39.45 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.02 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  27.75 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1990 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  31.9 
 
 		 410 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1631 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  31.61 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.18 
 
 		 892 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34 
 
 		 1015 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.33 
 
 		 937 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.33 
 
 		 937 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.25 
 
 		 508 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.07 
 
 		 396 aa  50.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1508 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.37 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.45 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.62 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.82 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.44 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  32.5 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 414 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  29.23 
 
 		 413 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.67 
 
 		 350 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.53 
 
 		 1749 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.53 
 
 		 1263 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  22.08 
 
 		 1680 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.32 
 
 		 761 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.72 
 
 		 1107 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  40.24 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.67 
 
 		 296 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28.24 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 412 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  34.44 
 
 		 757 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.35 
 
 		 291 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 447 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  32.45 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.84 
 
 		 653 aa  43.9  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  31.49 
 
 		 2198 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  34.29 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>