70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4565 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1640 aa  3367    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  35.1 
 
 		 2580 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  28.2 
 
 		 1634 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1631 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1611 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  30.29 
 
 		 1984 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1990 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1593 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1690 aa  275  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1625 aa  273  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1680 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1473 aa  259  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1262 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1439 aa  198  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1439 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1495 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1459 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1494 aa  192  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1275 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  28.55 
 
 		 971 aa  189  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1393 aa  185  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1847 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1376 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1481 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1473 aa  176  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1498 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1395 aa  172  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1481 aa  171  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1395 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1498 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1489 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1496 aa  155  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1497 aa  155  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1744 aa  152  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1508 aa  143  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26 
 
 		 1608 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  25.68 
 
 		 583 aa  71.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  24.83 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  24.22 
 
 		 755 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  23.29 
 
 		 622 aa  63.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  23.76 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  23.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  24.84 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  22.75 
 
 		 443 aa  61.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  23.64 
 
 		 755 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  23.85 
 
 		 565 aa  60.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  24.2 
 
 		 765 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  23.64 
 
 		 755 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.5 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  23.64 
 
 		 731 aa  60.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  25.3 
 
 		 615 aa  58.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  27.03 
 
 		 603 aa  56.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  24.28 
 
 		 788 aa  56.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  24.28 
 
 		 788 aa  56.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  24.28 
 
 		 788 aa  56.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30 
 
 		 1041 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.56 
 
 		 1263 aa  52.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.76 
 
 		 867 aa  52.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.09 
 
 		 886 aa  52  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32072  predicted protein  31.62 
 
 		 381 aa  50.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186816  normal  0.540489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.77 
 
 		 892 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.46 
 
 		 242 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.28 
 
 		 230 aa  48.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.35 
 
 		 1015 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.62 
 
 		 482 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.8 
 
 		 354 aa  47.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  31.43 
 
 		 2324 aa  48.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  25.64 
 
 		 776 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44362  predicted protein  29.84 
 
 		 1083 aa  46.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>