77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1101 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  45.02 
 
 		 1459 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  41.61 
 
 		 1439 aa  1025    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  37.93 
 
 		 1395 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  38.47 
 
 		 1393 aa  849    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 1376 aa  2755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  41.68 
 
 		 1439 aa  1016    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1395 aa  823    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1498 aa  413  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1495 aa  403  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1744 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1497 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1496 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1494 aa  358  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1481 aa  355  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1508 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1631 aa  303  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  30.53 
 
 		 1634 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1611 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1498 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1608 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1481 aa  238  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1473 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1473 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1593 aa  197  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1640 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29 
 
 		 1984 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1990 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1275 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.66 
 
 		 2580 aa  128  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1680 aa  128  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1690 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1262 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1625 aa  125  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1489 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.27 
 
 		 971 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1847 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  26.82 
 
 		 615 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  24.56 
 
 		 583 aa  84.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  26.23 
 
 		 776 aa  82  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  25.37 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  25.68 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  25.19 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  25.37 
 
 		 788 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  26.53 
 
 		 622 aa  74.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  25.31 
 
 		 603 aa  72  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  24.46 
 
 		 545 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  25.12 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  24.67 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  22.75 
 
 		 755 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  22.75 
 
 		 731 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  22.75 
 
 		 755 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.3 
 
 		 547 aa  64.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  25.87 
 
 		 443 aa  64.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.27 
 
 		 863 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  25.06 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  22.55 
 
 		 765 aa  61.6  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.59 
 
 		 1107 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.35 
 
 		 1015 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.54 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  22.75 
 
 		 755 aa  59.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25 
 
 		 713 aa  56.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.45 
 
 		 307 aa  56.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.41 
 
 		 1749 aa  55.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.65 
 
 		 1041 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.49 
 
 		 204 aa  54.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  28.46 
 
 		 647 aa  52.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.35 
 
 		 508 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  22.47 
 
 		 757 aa  50.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  37.39 
 
 		 1266 aa  49.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52988  predicted protein  29.25 
 
 		 512 aa  48.9  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0230627  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 867 aa  48.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.58 
 
 		 2132 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  30.3 
 
 		 789 aa  47.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  30.3 
 
 		 789 aa  47.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.41 
 
 		 354 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.75 
 
 		 1263 aa  45.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.93 
 
 		 886 aa  45.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>