22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52988 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52988  predicted protein  100 
 
 		 512 aa  1036    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0230627  normal  0.0756506 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05531  tubulin-specific chaperone, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11870)  27.91 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04390  hypothetical protein  23.1 
 
 		 576 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.55 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.46 
 
 		 779 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.46 
 
 		 765 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.9 
 
 		 542 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1085 aa  50.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  34.81 
 
 		 772 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  35.66 
 
 		 760 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5305  predicted protein  25 
 
 		 230 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  34.07 
 
 		 766 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.64 
 
 		 760 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  33.33 
 
 		 755 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  28.52 
 
 		 772 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33838  predicted protein  37.29 
 
 		 889 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0040379  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  35.71 
 
 		 766 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  30 
 
 		 1376 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.7 
 
 		 2324 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  26.05 
 
 		 877 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1744 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>