164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1815 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 772 aa  1548    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  46.69 
 
 		 587 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.96 
 
 		 760 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.57 
 
 		 1266 aa  134  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1052 aa  134  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  31.77 
 
 		 421 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  33.2 
 
 		 772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  34.3 
 
 		 766 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  33.88 
 
 		 755 aa  128  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  32.75 
 
 		 347 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  33.07 
 
 		 765 aa  127  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  33.07 
 
 		 779 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  33.07 
 
 		 542 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1351 aa  125  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  32.27 
 
 		 760 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.45 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.45 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.23 
 
 		 766 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  30.06 
 
 		 531 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  35.89 
 
 		 995 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.02 
 
 		 341 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.59 
 
 		 789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.59 
 
 		 789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1085 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  31.58 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  30.03 
 
 		 858 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.94 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.5 
 
 		 1088 aa  108  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  34.9 
 
 		 1070 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  34.9 
 
 		 1112 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  34.9 
 
 		 1070 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  30.7 
 
 		 954 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.92 
 
 		 1107 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  31.58 
 
 		 993 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  30.26 
 
 		 1012 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  32.86 
 
 		 994 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  34.39 
 
 		 384 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  32.27 
 
 		 1011 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  26.22 
 
 		 399 aa  99.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.64 
 
 		 284 aa  96.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  26.27 
 
 		 400 aa  97.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  29.43 
 
 		 498 aa  95.5  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  28.44 
 
 		 467 aa  94.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  35 
 
 		 539 aa  94  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  29.2 
 
 		 400 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  30.49 
 
 		 692 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  28.11 
 
 		 718 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.43 
 
 		 565 aa  91.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.69 
 
 		 877 aa  90.1  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  31.84 
 
 		 399 aa  87.8  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.93 
 
 		 1041 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  28.57 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.59 
 
 		 1015 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.5 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  24.55 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  27.98 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.33 
 
 		 765 aa  73.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  42.31 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  28.32 
 
 		 1780 aa  72  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.35 
 
 		 354 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  27.97 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  42.7 
 
 		 197 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  24.24 
 
 		 451 aa  67.4  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.78 
 
 		 242 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  26.12 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  27.55 
 
 		 631 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.93 
 
 		 1335 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  38.71 
 
 		 205 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1231 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  27.15 
 
 		 1263 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.96 
 
 		 1024 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  32.19 
 
 		 935 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.91 
 
 		 1344 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  32.35 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.73 
 
 		 713 aa  62  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  28.3 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 925 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1744 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  28.84 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  31.84 
 
 		 1290 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.71 
 
 		 892 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.57 
 
 		 863 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  27.86 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.69 
 
 		 1749 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  30.69 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  29.73 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  24.37 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.36 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  29.66 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  23.08 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.6 
 
 		 637 aa  57.4  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.69 
 
 		 867 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  26.18 
 
 		 418 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.19 
 
 		 482 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  23.88 
 
 		 467 aa  55.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  22.55 
 
 		 688 aa  54.7  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  27.56 
 
 		 571 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  26.25 
 
 		 523 aa  54.7  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.45 
 
 		 474 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  25.55 
 
 		 426 aa  54.3  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>