74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03490 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  100 
 
 
765 aa  1574    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  34.72 
 
 
1780 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  28.46 
 
 
1335 aa  158  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 
772 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  27.74 
 
 
1263 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.3 
 
 
1266 aa  68.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.7 
 
 
760 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  26.2 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.06 
 
 
1088 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  27.7 
 
 
766 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.6 
 
 
1107 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.78 
 
 
766 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.23 
 
 
772 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.7 
 
 
765 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.7 
 
 
779 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.7 
 
 
542 aa  64.7  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.23 
 
 
755 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.72 
 
 
760 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.91 
 
 
1744 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.19 
 
 
355 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.09 
 
 
1070 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.09 
 
 
1070 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.18 
 
 
1112 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  26.8 
 
 
523 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.2 
 
 
565 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  28.64 
 
 
994 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.47 
 
 
1052 aa  57.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.64 
 
 
1351 aa  57.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  24.65 
 
 
1085 aa  57.4  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  28.77 
 
 
993 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.28 
 
 
643 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.14 
 
 
995 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.28 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.56 
 
 
1041 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.78 
 
 
892 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.52 
 
 
354 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25 
 
 
1749 aa  54.3  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  26.71 
 
 
1012 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.87 
 
 
1059 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.84 
 
 
1344 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.7 
 
 
279 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.71 
 
 
954 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.02 
 
 
1015 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  26.88 
 
 
877 aa  52.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.2 
 
 
482 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.65 
 
 
242 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  25.34 
 
 
789 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  25.34 
 
 
789 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  27.34 
 
 
197 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.51 
 
 
863 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.65 
 
 
867 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  30.14 
 
 
1011 aa  51.2  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  25.82 
 
 
424 aa  50.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.1 
 
 
1679 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  30.43 
 
 
2324 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.04 
 
 
348 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.04 
 
 
348 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  24.78 
 
 
631 aa  48.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  30.14 
 
 
277 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.5 
 
 
692 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  33.64 
 
 
587 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.07 
 
 
2198 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  25.87 
 
 
757 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  28.09 
 
 
356 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.57 
 
 
347 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  24.46 
 
 
1024 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  28.69 
 
 
788 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  29.09 
 
 
284 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  22.46 
 
 
539 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.78 
 
 
858 aa  45.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  21.36 
 
 
421 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  21.63 
 
 
972 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  27.48 
 
 
935 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  28.69 
 
 
788 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>