19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34969 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  100 
 
 		 757 aa  1532    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  28.21 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  26.15 
 
 		 523 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  22.68 
 
 		 630 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  23.32 
 
 		 354 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25.18 
 
 		 1266 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.83 
 
 		 384 aa  52  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.44 
 
 		 355 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28340  Leucine rich repeat protein  25.66 
 
 		 704 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.669391  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.34 
 
 		 877 aa  48.5  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  26.78 
 
 		 690 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  22.88 
 
 		 424 aa  48.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.87 
 
 		 765 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1498 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  25.25 
 
 		 763 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  22.6 
 
 		 719 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  24.11 
 
 		 558 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  22.91 
 
 		 464 aa  45.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  22.36 
 
 		 772 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>