16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29610 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  100 
 
 		 630 aa  1274    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  29.02 
 
 		 523 aa  95.1  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.64 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  27.79 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  22.68 
 
 		 757 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.94 
 
 		 508 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  25.93 
 
 		 559 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  24.16 
 
 		 772 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.25 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  31.74 
 
 		 1335 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  25.14 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29338  predicted protein  26.44 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.91 
 
 		 1266 aa  45.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  27.06 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  33.64 
 
 		 1088 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  26.03 
 
 		 656 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>