90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2003 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  100 
 
 		 424 aa  854    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  57.18 
 
 		 631 aa  378  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  40.46 
 
 		 273 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.55 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  34.13 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  29.25 
 
 		 618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  36.64 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.48 
 
 		 1679 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  34.8 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  32.48 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  31.71 
 
 		 586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  29.92 
 
 		 581 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  29.84 
 
 		 816 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  27.22 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  33.33 
 
 		 318 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.73 
 
 		 1266 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  33.16 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.61 
 
 		 1041 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  27.75 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.82 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.33 
 
 		 1107 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1059 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.87 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.2 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  30.33 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.88 
 
 		 863 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  27.76 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  28.38 
 
 		 755 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.63 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30 
 
 		 755 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 755 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30 
 
 		 731 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  29.85 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  30.92 
 
 		 535 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  34.5 
 
 		 1780 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  31.4 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  31.03 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  32.4 
 
 		 765 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30.29 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  28.14 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.16 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.61 
 
 		 788 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.38 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  24.35 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.61 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.61 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.35 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.38 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.69 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.53 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.51 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.14 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.18 
 
 		 867 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  31.06 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.43 
 
 		 1749 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  24.48 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 937 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  26.61 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 937 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.51 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.09 
 
 		 1015 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1578 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  25.21 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  27.59 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  25.89 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.82 
 
 		 765 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  25.21 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.13 
 
 		 886 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  22.88 
 
 		 757 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  26.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  26.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.2 
 
 		 892 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  28.86 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  27.08 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.4 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.67 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.39 
 
 		 877 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.32 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  28.74 
 
 		 1335 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.74 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  27.06 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  23.03 
 
 		 2491 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  23.27 
 
 		 2132 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.68 
 
 		 757 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  26.01 
 
 		 1088 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.21 
 
 		 1344 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  26.44 
 
 		 523 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>