14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29216 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  100 
 
 		 719 aa  1454    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  30.94 
 
 		 677 aa  254  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  29.8 
 
 		 690 aa  250  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28340  Leucine rich repeat protein  28.49 
 
 		 704 aa  222  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.669391  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31744  predicted protein  26.26 
 
 		 672 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743293  normal  0.568196 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  26.72 
 
 		 656 aa  191  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28339  hypothetical protein  26.84 
 
 		 559 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.0915689 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31745  predicted protein  26.29 
 
 		 660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442814  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  24 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  24.86 
 
 		 523 aa  52  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.44 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.2 
 
 		 1107 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  22.34 
 
 		 757 aa  44.3  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  25.26 
 
 		 692 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>