15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28415 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1366    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28340  Leucine rich repeat protein  37.64 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.669391  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  30.94 
 
 		 719 aa  254  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31980  predicted protein  27.35 
 
 		 690 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.25184 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28339  hypothetical protein  28.47 
 
 		 559 aa  171  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.0915689 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31745  predicted protein  27.89 
 
 		 660 aa  157  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442814  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31744  predicted protein  26.86 
 
 		 672 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743293  normal  0.568196 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  26.15 
 
 		 647 aa  131  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  27.72 
 
 		 656 aa  103  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.3 
 
 		 755 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.3 
 
 		 755 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  31.06 
 
 		 765 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  29.76 
 
 		 301 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  27.49 
 
 		 388 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>