113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2893 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  100 
 
 		 587 aa  1187    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  46.69 
 
 		 772 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1052 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  41.07 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  30.97 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  35 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  35 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.21 
 
 		 858 aa  78.2  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  37.04 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.28 
 
 		 1088 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1085 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  26.01 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  40 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.15 
 
 		 284 aa  76.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  31 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  31 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  35.65 
 
 		 755 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34.78 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  31.71 
 
 		 1112 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  34.78 
 
 		 766 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  31.71 
 
 		 1070 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  31.71 
 
 		 1070 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  34.78 
 
 		 779 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  34.78 
 
 		 765 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  39.81 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  30.86 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  34.78 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  34.15 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  34.78 
 
 		 772 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  34.95 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  33.91 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  34.51 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.64 
 
 		 995 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.51 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  24.06 
 
 		 521 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  34.55 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  40.95 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  24.05 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  31.31 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  22.05 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0752  hypothetical protein  34.55 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.93 
 
 		 954 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  22.48 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  22.48 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  27.84 
 
 		 637 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  21.65 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  22.48 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  22.48 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  22.56 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  38.95 
 
 		 1011 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  22.09 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  35.58 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  29.85 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  22.48 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  25.54 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  22.48 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  22.48 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  21.71 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.99 
 
 		 1107 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  36.56 
 
 		 1351 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  33.33 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  29.2 
 
 		 1012 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1231 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  36.29 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  21.91 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.85 
 
 		 993 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.71 
 
 		 1266 aa  59.3  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  22.69 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  24.83 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.04 
 
 		 892 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  35.51 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  40 
 
 		 474 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  21.61 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  30.34 
 
 		 356 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.27 
 
 		 426 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  30.4 
 
 		 399 aa  53.9  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  30.13 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  34.02 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.95 
 
 		 565 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  20.87 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  30.23 
 
 		 279 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.36 
 
 		 374 aa  50.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  31.54 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  34.02 
 
 		 1335 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.65 
 
 		 867 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  31.07 
 
 		 1780 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.23 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  34.62 
 
 		 935 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2263  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  33.64 
 
 		 765 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  30.89 
 
 		 539 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92844  predicted protein  28.92 
 
 		 255 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67948  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  28 
 
 		 718 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 418 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.14 
 
 		 242 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  22.69 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>