83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19840 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  38.56 
 
 
531 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.84 
 
 
1085 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.83 
 
 
1052 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.96 
 
 
1070 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.96 
 
 
1070 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.96 
 
 
1112 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  31.31 
 
 
755 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.56 
 
 
765 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.31 
 
 
766 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.56 
 
 
779 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.56 
 
 
542 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.21 
 
 
1351 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.88 
 
 
760 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.8 
 
 
772 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  31.64 
 
 
772 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 
789 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 
789 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.86 
 
 
347 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.16 
 
 
760 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.7 
 
 
341 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  32.72 
 
 
399 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.09 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.09 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.1 
 
 
1088 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  43.75 
 
 
197 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.37 
 
 
766 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.6 
 
 
643 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  32.07 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.19 
 
 
995 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  31.25 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.58 
 
 
877 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  35.32 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  27.39 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  32.91 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25 
 
 
994 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.67 
 
 
858 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.22 
 
 
1011 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.29 
 
 
400 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  28.08 
 
 
993 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  27.15 
 
 
587 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.06 
 
 
1266 aa  76.3  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  25 
 
 
954 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  26.7 
 
 
1012 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  30.65 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  25.11 
 
 
718 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  32.56 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.69 
 
 
1086 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  33.11 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  30.57 
 
 
692 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.36 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  31.71 
 
 
165 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  31.72 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.5 
 
 
565 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  35.38 
 
 
1231 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  33.96 
 
 
356 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  26.23 
 
 
1780 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.14 
 
 
539 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  27.87 
 
 
1290 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.19 
 
 
637 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0278  hypothetical protein  29.2 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
2324 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.7 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0752  hypothetical protein  30.33 
 
 
600 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  30.67 
 
 
314 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92844  predicted protein  29.73 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67948  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  25.4 
 
 
384 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 
863 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  27.88 
 
 
621 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  29.09 
 
 
765 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  29.56 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.93 
 
 
1107 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  26.67 
 
 
809 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  26.56 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  28.69 
 
 
449 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  30.09 
 
 
935 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  28 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.03 
 
 
1024 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2295  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.24 
 
 
476 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.1 
 
 
1091 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.14 
 
 
757 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.28 
 
 
631 aa  42  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>