96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3741 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  827    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  35.18 
 
 
1085 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.02 
 
 
1266 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  31.77 
 
 
772 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.24 
 
 
531 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.41 
 
 
347 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  24.5 
 
 
718 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  23.53 
 
 
1052 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.51 
 
 
1070 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.51 
 
 
1112 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.51 
 
 
1070 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.33 
 
 
400 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.77 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  25.64 
 
 
1012 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.51 
 
 
858 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.26 
 
 
766 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  25.21 
 
 
954 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.67 
 
 
995 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.12 
 
 
760 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  25.57 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.62 
 
 
760 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  24.91 
 
 
755 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  24.91 
 
 
765 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  24.91 
 
 
779 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.42 
 
 
542 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  29.36 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30 
 
 
1107 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  26.3 
 
 
766 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.26 
 
 
772 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.85 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.45 
 
 
1351 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.85 
 
 
348 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  26.95 
 
 
994 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  26.84 
 
 
399 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25.64 
 
 
1088 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  28.27 
 
 
399 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.38 
 
 
1011 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  30.26 
 
 
789 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  30.26 
 
 
789 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  28.7 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  30.32 
 
 
643 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.39 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  25.36 
 
 
993 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  37.04 
 
 
587 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.64 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  26.51 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.51 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  27.07 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.09 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  26.19 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  29.85 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  25.42 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  26.76 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  30.21 
 
 
312 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  31.25 
 
 
205 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.9 
 
 
1024 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.11 
 
 
1335 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.24 
 
 
877 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.13 
 
 
344 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.95 
 
 
1655 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  26.01 
 
 
935 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.76 
 
 
692 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  24.75 
 
 
621 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  30.56 
 
 
197 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  28.3 
 
 
254 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  29.45 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.19 
 
 
559 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  31.96 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  29.84 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  28.57 
 
 
1015 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.1 
 
 
757 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  22.12 
 
 
1041 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  26.42 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  23.36 
 
 
1780 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  30.05 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  32.41 
 
 
314 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  19.78 
 
 
539 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  25.51 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  22.38 
 
 
565 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  22.89 
 
 
809 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  20.69 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  20.92 
 
 
1118 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.65 
 
 
1086 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  26.72 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1022  hypothetical protein  24.57 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.89 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30 
 
 
1744 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.66 
 
 
528 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  21.36 
 
 
765 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.95 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  26.53 
 
 
1370 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0386  hypothetical protein  28.09 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  27.23 
 
 
1290 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  29.32 
 
 
2324 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.67 
 
 
507 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>