35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05580 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  100 
 
 		 1118 aa  2164    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30.91 
 
 		 763 aa  161  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  29.7 
 
 		 700 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  29.49 
 
 		 571 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  32.95 
 
 		 639 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.6 
 
 		 1266 aa  102  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1394 aa  101  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  29.24 
 
 		 846 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1575 aa  92  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1270 aa  75.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.28 
 
 		 408 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1070 aa  59.3  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  34.02 
 
 		 394 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1085 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  24.91 
 
 		 718 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  20.92 
 
 		 421 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3306  hypothetical protein  25.86 
 
 		 694 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0912335 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2648  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1298 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  25.47 
 
 		 400 aa  50.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  32.24 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  35.71 
 
 		 617 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  37.04 
 
 		 416 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  27.62 
 
 		 467 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.46 
 
 		 347 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.95 
 
 		 1679 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1389 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.13 
 
 		 2042 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  34.25 
 
 		 1441 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  26.51 
 
 		 355 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  33.1 
 
 		 1112 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  33.1 
 
 		 1070 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  33.1 
 
 		 1070 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  45.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  31.96 
 
 		 924 aa  45.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1031 aa  44.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>