100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1170 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  100 
 
 
809 aa  1639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  41.03 
 
 
414 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  39.92 
 
 
497 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  31.53 
 
 
331 aa  127  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  36.7 
 
 
427 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  33.6 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  33.98 
 
 
2415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  34.12 
 
 
300 aa  112  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  34.71 
 
 
399 aa  111  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  34.12 
 
 
2670 aa  111  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  34.48 
 
 
907 aa  110  9.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  29.82 
 
 
1038 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  35.91 
 
 
253 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  34.09 
 
 
309 aa  104  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  33.09 
 
 
323 aa  101  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  34.7 
 
 
3060 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  32.19 
 
 
486 aa  98.6  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.01 
 
 
1227 aa  98.6  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  31.56 
 
 
634 aa  98.2  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  31.2 
 
 
1575 aa  97.8  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  27.78 
 
 
741 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  31.75 
 
 
500 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  33.47 
 
 
789 aa  94.7  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  36.02 
 
 
250 aa  93.2  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  37.16 
 
 
250 aa  92.4  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  35.63 
 
 
754 aa  90.9  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  28.03 
 
 
467 aa  89.4  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  30.6 
 
 
609 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  38.55 
 
 
251 aa  87.4  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.2 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  33.17 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  30.04 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.39 
 
 
1107 aa  81.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  28.42 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  29.73 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  26.81 
 
 
934 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  30.17 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  30.86 
 
 
774 aa  79.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  37.42 
 
 
173 aa  76.6  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  33.53 
 
 
405 aa  76.6  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  32.89 
 
 
898 aa  76.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  34.25 
 
 
272 aa  76.3  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  27.38 
 
 
558 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  31.55 
 
 
762 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  28.81 
 
 
862 aa  72.8  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  33.54 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  35.21 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  30.81 
 
 
800 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  29.36 
 
 
862 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  30.53 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  33.11 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  28.17 
 
 
933 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  28.5 
 
 
982 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  28.16 
 
 
857 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  30.06 
 
 
1214 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  31.01 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  30.2 
 
 
204 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  29.89 
 
 
200 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  38.02 
 
 
228 aa  62.8  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 
1085 aa  62  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  29.26 
 
 
521 aa  61.6  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  27.81 
 
 
658 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  24.59 
 
 
1041 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  37.86 
 
 
913 aa  57.8  0.0000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  36 
 
 
369 aa  56.6  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  31.76 
 
 
257 aa  56.2  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  38.2 
 
 
181 aa  55.8  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  35.11 
 
 
423 aa  55.8  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  42.31 
 
 
193 aa  53.9  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  39.29 
 
 
496 aa  53.1  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  29.94 
 
 
2833 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  40.51 
 
 
265 aa  52.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  27.92 
 
 
399 aa  52  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  19.92 
 
 
508 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  25.23 
 
 
863 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.09 
 
 
1344 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  25.61 
 
 
706 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  33.09 
 
 
182 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  36.14 
 
 
190 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  35.05 
 
 
180 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.72 
 
 
1351 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  29.01 
 
 
321 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  25.61 
 
 
744 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  29.23 
 
 
236 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  25.29 
 
 
275 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  30.25 
 
 
446 aa  47.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  30.08 
 
 
166 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  41.94 
 
 
95 aa  47.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  22.89 
 
 
421 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  25.63 
 
 
452 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  32.23 
 
 
324 aa  46.2  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  23.28 
 
 
354 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04560  protein of unknown function, DUF285  19.33 
 
 
283 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.593909  hitchhiker  0.000000409954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  20.87 
 
 
1263 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  45.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  32.43 
 
 
413 aa  45.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  36.45 
 
 
371 aa  45.4  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.05 
 
 
474 aa  44.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  28.83 
 
 
560 aa  44.7  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.5 
 
 
1749 aa  44.3  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>