85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0892 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  100 
 
 		 467 aa  945    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  65.84 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  61.54 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  63.37 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  58.35 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  60.2 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  58.56 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  35.65 
 
 		 1085 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  31.09 
 
 		 531 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  25.57 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  28.44 
 
 		 772 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.6 
 
 		 341 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.61 
 
 		 1266 aa  89.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1052 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.88 
 
 		 1112 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.88 
 
 		 1070 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.88 
 
 		 1070 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1351 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.98 
 
 		 1088 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.29 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.29 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.71 
 
 		 772 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  27.23 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.67 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  32.07 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.27 
 
 		 765 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.27 
 
 		 779 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.65 
 
 		 766 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.65 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.67 
 
 		 995 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  30.73 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.73 
 
 		 760 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  30.72 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  29.27 
 
 		 766 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.78 
 
 		 755 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.67 
 
 		 877 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  27.8 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.27 
 
 		 760 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.44 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.22 
 
 		 858 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  27.91 
 
 		 718 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  32.42 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.37 
 
 		 1107 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  30.33 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.15 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.56 
 
 		 789 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.56 
 
 		 789 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  27.12 
 
 		 1012 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.55 
 
 		 954 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.26 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  23.47 
 
 		 993 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.59 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.12 
 
 		 994 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  28.02 
 
 		 1011 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.48 
 
 		 863 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.97 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.16 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.14 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1231 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  29.88 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  30.23 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.38 
 
 		 197 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  28.84 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  22.22 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  30.49 
 
 		 314 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.87 
 
 		 1086 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  24.74 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  28.92 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  30.12 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  23.38 
 
 		 211 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.75 
 
 		 886 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  27.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.05 
 
 		 867 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  28.08 
 
 		 1118 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  30.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.52 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.49 
 
 		 1679 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.8 
 
 		 1749 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  24.02 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  27.39 
 
 		 1780 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  29.61 
 
 		 621 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0331  hypothetical protein  33.12 
 
 		 290 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  30.25 
 
 		 682 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  26.6 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.65 
 
 		 1091 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>