79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1551 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 399 aa  801    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  63.37 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  62.66 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  64.84 
 
 		 400 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  64.07 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  59.5 
 
 		 399 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  55.58 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36.32 
 
 		 1085 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.06 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  31.84 
 
 		 772 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  32.11 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  32.88 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.2 
 
 		 760 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.39 
 
 		 1112 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.8 
 
 		 760 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  29.73 
 
 		 995 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  27.39 
 
 		 1070 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  27.39 
 
 		 1070 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.6 
 
 		 772 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.8 
 
 		 766 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1351 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  26.8 
 
 		 766 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.4 
 
 		 755 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.8 
 
 		 779 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.8 
 
 		 765 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.88 
 
 		 1088 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.83 
 
 		 542 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.56 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.21 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.21 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.61 
 
 		 954 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  33.54 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  33.54 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  26.61 
 
 		 1012 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32.87 
 
 		 858 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  32.8 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.44 
 
 		 1266 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.91 
 
 		 994 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  24.44 
 
 		 565 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  32.5 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  27.39 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.93 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  25.32 
 
 		 993 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.61 
 
 		 1011 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  33.54 
 
 		 877 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  36.29 
 
 		 587 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.85 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  28.88 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  26.7 
 
 		 718 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  32.62 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  40.48 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  27.06 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  40.22 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  32.73 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 867 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  27.75 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.39 
 
 		 631 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  32.52 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.99 
 
 		 344 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 		 1655 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.41 
 
 		 1086 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  25.49 
 
 		 211 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  31.39 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  31.88 
 
 		 238 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  29.73 
 
 		 1290 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.45 
 
 		 1091 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  30.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  29.94 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  29.05 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  29.53 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.69 
 
 		 637 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1231 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  23.42 
 
 		 528 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  28.38 
 
 		 765 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.14 
 
 		 886 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1059 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>