72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1202 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  100 
 
 		 399 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  68.92 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  59.6 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  58.56 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  58.17 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  59.5 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  58.6 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36 
 
 		 1085 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.63 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  26.87 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  31.28 
 
 		 531 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.12 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.27 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.27 
 
 		 348 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1351 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.85 
 
 		 1088 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.18 
 
 		 1070 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.15 
 
 		 1266 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.18 
 
 		 1070 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.91 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.18 
 
 		 1112 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  24.11 
 
 		 755 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  24.11 
 
 		 766 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  24.55 
 
 		 772 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1052 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.63 
 
 		 995 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.11 
 
 		 772 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  24.68 
 
 		 760 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  22.55 
 
 		 760 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  22.98 
 
 		 765 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  22.98 
 
 		 779 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  22.98 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  22.88 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  34.76 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.44 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28 
 
 		 858 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  27.81 
 
 		 789 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  27.81 
 
 		 789 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  30.54 
 
 		 954 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  30.54 
 
 		 1012 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  20.7 
 
 		 994 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30 
 
 		 877 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  31.96 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  25.48 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  22.61 
 
 		 993 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.6 
 
 		 1011 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  27.51 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  25.35 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  32.45 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  27.47 
 
 		 692 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  29.51 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  35.34 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  23.49 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  32.26 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  29.84 
 
 		 539 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.92 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  29.25 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.61 
 
 		 1086 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  28.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  30.77 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.7 
 
 		 631 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  30.13 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.23 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  30 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.71 
 
 		 1655 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1231 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  34.15 
 
 		 356 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  35.19 
 
 		 1290 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  26.36 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  24.85 
 
 		 765 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.34 
 
 		 559 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>