83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3230 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1419    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.27 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.6 
 
 		 1266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1085 aa  104  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.08 
 
 		 348 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.08 
 
 		 348 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.3 
 
 		 760 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.19 
 
 		 766 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.69 
 
 		 760 aa  94  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  25.19 
 
 		 755 aa  94  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.28 
 
 		 995 aa  94  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.72 
 
 		 772 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.53 
 
 		 772 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  24.81 
 
 		 766 aa  91.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  24.42 
 
 		 779 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  24.42 
 
 		 765 aa  90.5  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.24 
 
 		 1070 aa  90.5  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.24 
 
 		 1070 aa  90.5  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.24 
 
 		 1112 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.27 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1052 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  24.12 
 
 		 1088 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  26.37 
 
 		 1012 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.56 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1351 aa  84  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  26.77 
 
 		 994 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  29.89 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  29.89 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  24.58 
 
 		 993 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  31.72 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  27.73 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.3 
 
 		 1107 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.27 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.7 
 
 		 954 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.15 
 
 		 1011 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.79 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  24.89 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  22.03 
 
 		 643 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  30.6 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.34 
 
 		 877 aa  67.4  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  25.35 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  28.48 
 
 		 400 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  24.76 
 
 		 1024 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  30.7 
 
 		 355 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  29.48 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.11 
 
 		 858 aa  60.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.64 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.67 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  26.42 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  30.71 
 
 		 238 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.15 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  23.82 
 
 		 528 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  31.84 
 
 		 621 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  36.89 
 
 		 587 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  29.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  37.37 
 
 		 356 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.7 
 
 		 1749 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.07 
 
 		 197 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2263  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.85 
 
 		 565 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.61 
 
 		 1091 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.67 
 
 		 1086 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  23.01 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  23.99 
 
 		 1106 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  28.16 
 
 		 1290 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.64 
 
 		 713 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.18 
 
 		 279 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2295  hypothetical protein  32.42 
 
 		 239 aa  48.9  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  25.54 
 
 		 508 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.37 
 
 		 474 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  21.62 
 
 		 558 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2451  hypothetical protein  28.34 
 
 		 362 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  22.96 
 
 		 1335 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 539 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  29.76 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  25.52 
 
 		 631 aa  45.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  29.45 
 
 		 205 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  21.05 
 
 		 935 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  24.04 
 
 		 571 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1073  hypothetical protein  29.28 
 
 		 216 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.944455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>