18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1073 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1073  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.944455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0331  hypothetical protein  37.74 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  27.44 
 
 
621 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0953  hypothetical protein  25.73 
 
 
310 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 
531 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  34.78 
 
 
757 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.85 
 
 
995 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  28.21 
 
 
539 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.77 
 
 
760 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  26.45 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.51 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  44.64 
 
 
1052 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  29.28 
 
 
718 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  25.32 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  27.54 
 
 
399 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.34 
 
 
772 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.24 
 
 
772 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  24.46 
 
 
355 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>