46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3929 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3929  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0278  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1101  hypothetical protein  29.26 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30 
 
 		 766 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.02 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  29 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.7 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1085 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  36.67 
 
 		 772 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.61 
 
 		 1070 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.61 
 
 		 1112 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.61 
 
 		 1070 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.72 
 
 		 755 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  27.72 
 
 		 766 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.77 
 
 		 542 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.48 
 
 		 779 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.48 
 
 		 765 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.93 
 
 		 1088 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.73 
 
 		 772 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  24.46 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  34.78 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1052 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  34.34 
 
 		 789 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  34.41 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  34.34 
 
 		 789 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  30.59 
 
 		 718 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  35.14 
 
 		 643 aa  50.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.87 
 
 		 347 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 		 531 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.47 
 
 		 994 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  25.81 
 
 		 995 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  24.76 
 
 		 1012 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  34.25 
 
 		 205 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  24.53 
 
 		 993 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.74 
 
 		 1011 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  23.81 
 
 		 954 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  31.4 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.84 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.11 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.11 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  32.61 
 
 		 279 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  32.5 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 877 aa  43.9  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  31.25 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>