85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2048 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  100 
 
 		 528 aa  1068    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  36.74 
 
 		 523 aa  291  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  33.27 
 
 		 539 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.34 
 
 		 565 aa  236  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  25.93 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  28.38 
 
 		 1266 aa  87.8  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.6 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  28.16 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.11 
 
 		 1041 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  25 
 
 		 766 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  23.79 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  23.79 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.96 
 
 		 863 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  23.79 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  23.98 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  31.79 
 
 		 763 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.24 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  23.58 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  22.94 
 
 		 993 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.19 
 
 		 772 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  25.81 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  23.16 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.93 
 
 		 954 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.5 
 
 		 1015 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  23.16 
 
 		 760 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1159  hypothetical protein  30.15 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25.64 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25.64 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25.64 
 
 		 1112 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  29.25 
 
 		 1012 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  27.43 
 
 		 384 aa  57  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  24.06 
 
 		 789 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  24.06 
 
 		 789 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.94 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  25.96 
 
 		 643 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.61 
 
 		 631 aa  53.9  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1389 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.67 
 
 		 886 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  25.48 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0823  hypothetical protein  30 
 
 		 352 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.98 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.51 
 
 		 890 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.67 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  27.59 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.41 
 
 		 1088 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  21.82 
 
 		 994 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  34.9 
 
 		 484 aa  50.8  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.12 
 
 		 535 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  25.62 
 
 		 772 aa  50.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  34.58 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  31.75 
 
 		 788 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  31.75 
 
 		 788 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  31.75 
 
 		 788 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  24.49 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  33.07 
 
 		 603 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  26.57 
 
 		 1216 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  40.24 
 
 		 776 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.45 
 
 		 2132 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 1679 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  30.97 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.86 
 
 		 348 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.86 
 
 		 348 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.9 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.39 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.88 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  26.03 
 
 		 995 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  21.81 
 
 		 1011 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  24.02 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  40.24 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2054  hypothetical protein  27.37 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  35.79 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  26.72 
 
 		 421 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.87 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.35 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.02 
 
 		 937 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  25.13 
 
 		 374 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.02 
 
 		 937 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  29.5 
 
 		 1335 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1085 aa  43.9  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.79 
 
 		 279 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1259 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1976 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.09 
 
 		 1107 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>